逃亡日本，而应桂馨与赵秉钧皆于1914年袁世凯掌控中国之后被害，此时袁世凯既然已经脱掉了宪政的外衣，明目张胆的实行独裁，且当时举国舆论都认定他是幕后凶手，实无杀人灭口的必要了。
第二，应桂馨跟陈其美同为上海青帮大佬，并且早前还曾经是陈其美的心腹。为什么赵秉钧要选他这个人来做暗杀宋教仁的中间人呢？
第三，上海、北京两个城市地位特殊，寻常每日往来电报数目惊人，陈其美的心腹吴佩黄如何能够确定就是北方下的命令？
第四，神秘的举报人王阿发到底是谁？他在口供中是这么说得，“几天前我在文元坊应桂馨家里兜售古董，因为应桂馨是我的老主顾，平素很熟。应桂馨这天突然拿出一张照片，叫我在某时某地把这个人暗杀掉，许以事成之后给我一千元做报仇。我因为只懂得做买卖从未杀过人，因此不敢承担这事。当时我并不知道照片上的人是谁，今天我在报纸上看到宋先生的照片，正是应桂馨让我杀掉的人。我相信若是能够找到应桂馨，便可以找到凶手！”
前三条都不说了，单单只是第四条那个王阿发的话里面的毛病就很多。青帮大佬应桂馨要找杀手手下小弟多少，即便是为了避嫌，也可以利用其它关系找人，为什么要找他一个‘从未杀过人’的古董商人。而且，国会大选几个月，宋教仁的照片天天见报，他竟然称不知道照片上的人是宋教仁，这句推脱的话已经泄露了不少的信息。最最让人怀疑的还是最后一句话，为什么他那么急促的让巡捕去捉拿应桂馨，怎么看都有种硬要将屎盆子扣在他脑袋上的感觉！
而这又牵扯到了后世的另一桩说法了！即宋教仁为陈其美秉承孙文命
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