廷当然不可能绝对相信郑芝龙的。只是现在海军之面确实没有人能取代郑芝龙，也不得不用他，但一直对他加以防范，由其是在上船的时候，一定对郑芝龙进行严密的监视。毕竟海上不比陆地，一但郑芝龙架船出海逃走，清廷还真就只能望洋兴叹。
郑芝龙也清楚自己的处境，虽然现在他是龙搁浅滩，但他的阅历、见识、眼光在这个时代还是十分突出的，由其是上了清廷的当之后，更是増涨了许多教训，因此也看得出，现在清廷并不是南京政府的对手。自己留在清廷，恐怕难有好结果。
这到并不是说商毅击败清廷之后，会把自己当清廷官员处死，因为看在郑成功的面子上，保住自己的命还是可以的，但清廷会不会放过自己，还很难说。毕竟现在清廷重用自己，是实在没有办法，一但到了灭亡的时候，很有可能会先把自己干掉，也说不定。
在清廷的这些时日里，郑芝龙也不是没想过要逃跑，由其是受命出任水师提督之后，更是觉得机会来了，只要是到了海上，自己可就是龙归大海了。但清廷也早预料到这一手，对他的监视也更为严密，毎次出海的时候，几乎就像是押犯人一样，随时都有六七个人围在郑芝龙的身边，稍有举动，就立刻有人过来阻止也让郑芝龙意识到，自己根本就一点办法都没有。
在这种情况下，郑芝龙也决定暂时放弃逃路的打算，而是全力先取得清廷的信任再说，因此在组建海军的工作中，也十分努力。现在已经训练了五千多名水军士兵、水手、船员等，并从民间搜罗到多种船只一百二十余条，又监造了三十余条船只，至少也使清廷的海军初建规模了。
不过现在清廷海军的战船中，基本都是二三
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