次挑衅毫不在意，灵雨折腾了几次后也没皮调，被段飞暗中责备了两次，终于藏起了锋芒。
改土归流的阻力是极大的，段飞夹胜利之势，做出以瑶治瑶的退步，又逼得岑璋等大土司放弃了权利受限支持改土归流，但是实际施行起来的时候，依然遭到了重重阻挠，他刚想离开柳州返回桂林，就听说立波的土司带头造反了。
立波只是开始，随着改土归流的推广执行，造反的各地土司此起彼伏，不得已之下段飞只好向正德写了份奏折，请正德批准他在广西多呆段时间，直到广西局势稳定下来再回京复旨。
半个月后京城中传回正德的旨意，正德对段飞顺利平叛并且损失大面积推行改土归流非常赞赏，正德命段飞暂时留在两广完成改土归流的任务，同时对沈希仪等将领颇多嘉许。
沈希仪对段飞更是感激，亲自率兵四处镇压叛乱，同时按照段飞的意思，在平叛地区展开彻底改土归流，一连平复数个地区之后，岑璋终于看不过眼了，他亲自出面号召各地区的小土司们不要再与朝廷顽抗，接受改土归流的政策，否则必将适得其反。
岑璋的话让一些土司听进去了，不过依然有些人不信邪，七月、八月转眼就过去了，广西境内依旧断断续续爆发了几起叛乱，因为缺乏支持，都被迅速扑灭，金牛卫火枪队立下了赫赫战功。
段飞身在柳州，却牵挂着江南的倭患，九月十月正是倭寇顺风顺水袭掠大明的季节，今年也不例外，不过江南百姓官兵都经历过四五月的成功抗倭，士气大涨，在大家积极备倭之下，捷报频传，来袭的倭寇多数在海上就被歼灭俘虏，偶尔上到岸上，也逃不过遍地陷阱和百姓们的天罗地网，抓到的倭寇到
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