此事定下了基调：“尹爱卿所言, 字字真挚，足可见他的悔过之意。人非圣贤，谁能不犯过错？知错能改，善莫大焉。对尹爱卿的迷途知返，朕深感欣慰。只是，过错有大小——有些过错朕可以睁一只眼闭一只眼放过, 有些过错却必须以律法来裁决。”
“三司觉得，尹爱卿之罪，该如何责罚最为合适？朕觉得他有心悔过, 可罪减一等；主动请罚，再减一等。你们以为如何？”
刑部尚书、大理寺卿、督察院左右都御史出列，互相瞧了瞧。刑部尚书思忖片刻，字斟句酌地回道：“回禀陛下，臣等以为，若是罪减二等，便只需将尹阁老削职为民，流放两千里并杖一百。不过，律法中可以用财物赎罪。尹阁老在献出不当所得的财物后，再交铜钱五十贯，就能安然回乡了。”
朱祐樘略作思索，微微颔首：“就照此办理，尹爱卿之罪过，不祸及家人子孙。尹家子弟为官，若是品性正直、能力斐然，亦可照常升迁。”这句话并不仅仅是说给尹直听的，毕竟尹直掌权之日尚短，来不及提携自家子孙。传奉官废黜后，剩下来的尹家人多半是靠着真才实学才留在了朝堂里。