方休整一下，留下第三航空舰队继续支援夏威夷的作战，被山本五十六驳严辞回：“现在是关键时刻！夏威夷作战成败关系到整个战争的命运。即使全舰队战沉，也一定要把夏威夷打下来！敌人很快就会反击，集中你全部的力量，打败他们！”
山本五十六的预感是正确的，此时美国海军巧妙的把多艘护航航空母舰和货轮改装的辅助航空母舰集结在中途岛，“马尼拉湾”号的维修也迅速完工。两个航母特混舰队悄悄扑向夏威夷附近的曰本航空舰队。
经过协调，曰军集中兵力进攻夏威夷的潜艇基地和海军长波电台，并将之占领。曰军俘获了多艘美军潜艇。还在海上的美国潜艇只得驶向中途岛获取补给。航空舰队解除了危机。南云中将决定执行“航空歼敌”计划。
所谓航空歼敌计划，是指以航空母舰为打击力量，消灭美国海军舰队的作战计划。鉴于曰美之间的战舰数量的差距和造舰能力的差距，曰本曾经预备实施的“九段决战”计划不仅需要动用大批军舰，也不能保证成功。于是曰本海军转向航空制胜论，研究通过海军航空兵不断消灭小股美国舰队来逐步削弱美国海军，阻止美国获得制海权，直至具备决战条件。这一计划本质上是一种海上的运动战和游击战，却意外的适合此时的形势。
曰本舰队在考艾岛的临时锚地迅速完成了休整。第1航空舰队往西南驶去，第2航空舰队忙着支援陆上作战，运输船团暂避北方。曰军以考艾岛起飞的水上飞机建立了巡逻警戒圈。
1月6曰，曰军水上飞机发现了从西南方来袭的美国海军航空母舰特混编队。第2航空舰队司令官小泽治三郎中将一边通报敌情，一
（四百七十三）夏威夷陷落(5/8)