地方武装还在做着垂死的挣扎，但是在大中军和朝-鲜仆从军的围剿之下，一股股的逐渐被绞杀。
而倭国也就此彻底宣告覆灭。
随军的一些大中朝军中文员记录下了这一场灭国之战，后来带回了国内，一些大中朝的官员看到了着一些有关东征之战的记录，感觉这么做实在是太过残忍，于是向于孝天建言，劝于孝天能下旨阻止大中军如此暴行。
但是于孝天对此置之不理，并且下旨查没所有有关东征的书面记载，并且向孟飞下达了封口令，着令孟飞对所有东征参战的人员，下达封口令，不得将他们在倭国所制造的各种暴行，传回国内。
整个东征倭国之战，算上后期对各地的清剿，一共历时两年时间，整个倭国基本上没大中军全面控制，可以说倭国各地，都被杀的是尸横遍野，后来以至于连收尸的人都找不到了，无奈之下孟飞为了避免给大中军造成瘟疫蔓延，这才下令减少了屠杀，留下一部分倭人，专门收尸，大量尸体就地直接挖出大坑掩埋，靠近海边的则把尸体直接投入大海喂鱼。
后世有史学家曾经对这场东征之战进行了一番考察，当时日本人口总共已经达到了将近五千万人左右，但是在战争结束之后，整个日本据说只剩下了不到五百万人口，整个人口十去其九，史称戊子之屠。
即便是后来剩下的这不足五百万倭人，在后来持续的十几年反复的屠杀事件之中，也基本上彻底泯灭，包括倭国留下的各种历史文献以及诸多建筑遗迹，也都纷纷被泯灭，甚至于连倭国的文字，也被禁绝使用，最终导致历史上东方岛国日本，成了一个谜一般的过去式。
因为后来在东征结束之后，当时的主帅孟飞
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