就能保证一定是1996年的费城，而不是什么1992年的迈阿密或者1998年的洛杉矶？”
“继续让他执行任务，他比我们任何人都有经验。”很快大人物就拍板了。
科学家虽然不爽，但还是安排詹姆斯继续进入时空旅行者。这一次，科学家还是非常靠谱地将詹姆斯送到了1996年的费城，距离瘟疫爆发还有几个月。这个时候詹姆斯忽然觉得自己不应该太自私了，既然自己有了能力，为什么不想办法解决这个人类的最大麻烦？不过让詹姆斯有些奇怪的是，他在这里发现了一个极端的动物保护组织——12只猴子军团。
他们反对所有动物实验，无论是美容产业还是医疗产业。他们会用非常恐怖的手段针对动物实验，时不时就有科学家被杀害，实验室被烧毁的消息传出来。让詹姆斯不解的是，这个保护组织的某些理论居然和自己不谋而合。詹姆斯的脑海里浮现出了一个名字，杰弗里。于是詹姆斯开始调查期12只猴子军团和杰弗里有什么关系，因为在后世，12只猴子军团可是大名鼎鼎。
因为正是12只猴子军团的极端动物保护主义，将一个传染病研究院的实验猴子释放出来，导致致死瘟疫在全球蔓延开来。更让人无法接受的是，他们还杀死了所有的研究人员并焚毁了实验室，根据知情人士说，实验室其实已经快要研究出疫苗来了。可以说，这些动物极端保护主义者打开了潘多拉的魔盒，却将希望给抹杀掉了。
接下去的情节便是詹姆斯调查12只猴子军团的故事，同时詹姆斯还遇到了当年和自己有过数面之缘的精神病师凯瑟琳。不过凯瑟琳已经不认识詹姆斯了，因为她还以为詹姆斯还在疯人院里。和其
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